维修基金通常由 房地产行政主管部门或房产管理部门进行代管。具体来说，维修基金是住宅物业的业主为了本物业区域内公共部位和共用设施、设备的维修养护事项，按照一定标准缴纳至专项账户，并授权业主委员会进行统一管理和使用的基金。
在实际操作中，各地可能会成立专门机构，或者委托其他部门来管理和监督维修基金。维修基金主要用于物业共用部位、共用设施设备保修期满后的维修、更新和改造。使用时，必须遵守相关法律法规，还要经过业主共同决定的程序。维修基金的管理要遵循专款专用、专户存储、按幢设账、核算到户的原则。
因此，维修基金的具体管理部门可能因地区而异，但通常都是隶属于房地产行政主管部门或房产管理部门。