在初中，学生通常是不允许留级的，但在特殊情况下可以办理休学。以下是办理休学的一般流程和注意事项：
因病休学
学生因病无法坚持正常学习或暂时不宜在校继续学习超过三个月以上，可以向学校提出书面申请，并出具区县级以上医院疾病诊断书或其他有效证明。
申请时需要填写休学申请书，保证愿意承担因此而产生的一切后果。
学校审核同意后，会出具休学证明，并携带学籍簿到市教育行政部门审批。
休学时间一般为一年，休学期满后，学生及其监护人需持休学证书向学校提出复学申请，经学校审核同意后，准予复学，并按其实际文化程度编级学习。
其他特殊情况
学生因出国探亲、自费留学等原因需暂时中断学习的，也可以申请休学。学校会审查学生出国签证等材料，并及时到教育主管部门办理休学手续。
患有传染病或患有区（市）级以上医疗单位认为不宜在学校正常学习疾病的学生，应当及时到教育主管部门办理休学手续。
注意事项：
休学期间，学校保留学生学籍，休学期限一般为一学年，出国探亲或留学的，休学期限不超过二学年。
休学期未满一年，原则上应在本年级复学。
不办理手续擅自休学，责任自负。
建议：
家长首先分析学生学习不好的原因，如果是因为学习习惯不好或对学习失去兴趣，留级可能起不到提高成绩的作用。如果学生确实勤奋好学，因某种原因耽误了学习，留级才有实际作用。
在申请休学时，家长应认真准备相关证明材料，并确保所有手续齐全，以便顺利通过审批。
总之，在初中阶段，学生因特殊原因确实需要留级时，可以通过办理休学手续来实现。家长和学生应充分了解休学的条件和流程，做好充分的准备。