圣托马斯大学提供多种专业，包括但不限于以下领域：
文科类专业：天主教研究、人类学、经济、犯罪学、环境研究、电影研究、地理、历史、法律、语言学及实用语言研究、大众传媒、音乐、哲学、宗教、女性研究。
应用文科专业：犯罪司法、老人医学。
教育类专业：教育学。
社会工作专业：社会学。
商科与行政管理专业：财务/会计、商业沟通技巧、人力资源管理、国际商业研究、国际贸易简报。
工程类专业：精算学、艺术史、生物化学、生物学、商业、天主教研究、化学、古典文明学、信息学。
计算机科学专业：计算机和信息科学、信息系统、信息技术、软件系统等。
医学专业：医学技术、药剂学、护理、职业治疗、理疗学、体育运动科学、语言障碍矫正。
其他专业：中等教育、小学教育、食品科技、营养学、图书馆与信息服务、数学、应用物理、建筑学、音乐教育、音乐文献、音乐理论、音乐剧、音乐技术、作曲、指挥、声乐、打击乐、钢琴、吉他、小提琴、小号、管理会计、亚洲研究、行为科学、大众传媒、经济学、新闻学、法律管理、文学、哲学、政治学、社会学、广告艺术、工业设计、室内设计、油画、酒店管理、旅游管理等。
圣托马斯大学的专业设置丰富，旨在满足不同学生的需求，并提供高质量的教育