农村建房超面积的处理方式主要依据《中华人民共和国城乡规划法》和《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，具体处理方式如下：
罚款
超出面积在合理范围内（例如20平方米以内）可能不收取费用。
超出20-70平方米的部分，按每年每平方3元来收取费用。
超出70平方米的部分，每增加50平方米，收费标准可能会提高3元每平米。
拆除
如果超面积情况严重，影响到了村庄的整体规划或者违反了相关的土地管理规定，超出的部分可能会被要求限期拆除。拆除过程中产生的费用一般由建房者自行承担。
限制产权
超平方的房屋可能无法获得完整的产权证明，对于超出规定面积的部分，可能无法取得宅基地使用权证及房屋所有权证等相关证件。这会在后续的房屋交易、拆迁补偿等方面带来一系列的问题。
有偿使用
对于超出面积的部分，可以采取有偿使用的政策，按照宅基地有偿使用的政策要求和标准，向相关部门缴纳一定的费用。具体费用标准视情况而定，一般是超出的面积越多，需要缴纳的费用自然也会更多。
收回
对于总面积严重超标的，政府有权将多出的宅基地面积执行回收处理。这种方式旨在保障农村宅基地的合理利用和规划。
暂时保留
在某些情况下，如果拆除超面积部分会影响相邻居住人员的居住安全或村集体的公共利益，该房屋可能会被暂时保留，直到找到合适的解决方案。
转让
如果建房者希望保留房屋但超出面积，可以通过合法途径将多余面积以有偿方式提供给其他需要的人，这样既解决了自身问题，也促进了资源的合理流动。
补缴费用
对于超面积部分，建房者需要根据当地规定补缴一定的费用，例如宅基地使用费。具体补缴金额和方式需与村集体协商并上报上级部门批准。
建议
主动报告：如果建房者主动报告超面积情况，并积极配合相关部门的处理，可能会减轻或避免处罚。
合法合规：在建房过程中，应严格遵守相关法律法规，确保建房面积符合审批标准，避免因超面积而引发后续问题。
咨询专业人士：在处理超面积问题时，建议咨询当地相关部门或专业律师，了解具体政策和法律后果，选择最合适的处理方式。