企业可以通过以下几种方式查询员工的学历：
要求员工提供学历证明
员工需提供学位证书、毕业证书等学历证明文件。
联系学校或教育机构
企业可以直接联系员工毕业的学校或教育机构，核实员工的学历信息。
使用第三方学历认证机构
企业可以要求员工通过社会认可的学历认证机构进行认证。
第三方背景调查公司
通过第三方背景调查公司进行学历验证，这些公司会与学校或教育机构联系，核实员工学历信息。
学信网查询
企业人力资源管理人员可以登录学信网，输入员工姓名和证书编号查询。
要求员工个人在学信网上打印学历报告，如果是毕业不到半年的学生，学信网是免费的，超过半年则需支付一定费用。
以上方法可以帮助企业验证员工学历的真实性。需要注意的是，不同国家和地区可能有不同的查询方法和规定，企业应根据实际情况选择合适的方法。